La dernière glaciation connue sous le nom de Wisconsinien entame son retrait autour de 18 000 AA (avant aujourd’hui). Au Québec, l’Inlandsis Laurentidien atteint la rive sud du Saint-Laurent autour de 12 700 AA. Avec une calotte glaciaire pouvant atteindre 3 km d’épaisseur, la région du Saguenay–Lac-Saint-Jean ne sera complètement libérée qu’autour de 8500 AA. Le retrait du glacier laisse place à l’épisode de la mer de Laflamme qui couvre les basses terres du lac Saint-Jean entre 10 300 AA et 8000 AA.
À ce jour, les indices démontrent deux voies distinctes de pénétration dans le territoire. Selon les données actuelles, les premiers déplacements se seraient effectués par des groupes de la région du Maine, passant à l’intérieur des terres pour se rendre à l’embouchure du Saguenay autour de 7000 AA. Tandis que d’autres groupes partent de la région du lac Champlain pour emprunter la rivière Saint-Maurice afin de se rendre dans les basses terres du lac Saint-Jean via les rivières Ouiatchouan et Métabetchouane, marquant ainsi le début de la présence humaine sur le territoire autour de 5000 AA.